7פרקי החלק השני הם מ"ח ואלו הם:
8
| פרק א' יתחייב לפי ההקדמה | פרק י"ז כל מתחדש |
| פרק ב' זה הגשם החמישי | פרק י"ח הדרך הראשון |
| פרק ג' דע כי אלו הדעות | פרק י"ט כבר התבאר לך |
| פרק ד' אמנם היות הגלגל | פרק כ' אריסטו מבאר |
| פרק ה' אמנם שהגלגלים | פרק כ"א דע כי מן האחרונים |
| פרק ו' אמנם שהמלאכים | פרק כ"ב גזרה, מוסכם עליה |
| פרק ז' כבר ביארנו שיתוף | פרק כ"ג דע כי ההקש |
| פרק ח' מן הדעות הקדומים | פרק כ"ד כבר ידעת |
| פרק ט' כבר ביארנו לך | פרק כ"ה דע כי אין בריחתנו |
| פרק י' ידוע ומפורסם | פרק כ"ו ראיתי לר' אליעזר |
| פרק י"א דע כי ענייני התכונה | פרק כ"ז כבר ביארתי לך |
| פרק י"ב מבואר שכל מחודש | פרק כ"ח הרבה מאנשי |
| פרק י"ג דעות האנשים | פרק כ"ט דע כי מי שלא יבין |
| פרק י"ד לא אצטרך להשיב | פרק ל' דע שיש הפרש |
| פרק ט"ו כוונתי בזה הפרק | פרק ל"א אולי כבר התבאר |
| פרק י"ו זה הפרק אבאר לך | פרק ל"ב דעות בני אדם |
| פרק ל"ג יתבאר לי שבמעמד | פרק מ"א איני צריך לבאר |
| פרק ל"ד זה הפסוק אשר בא | פרק מ"ב כבר ביארנו כי כל |
| פרק ל"ה כבר ביארתי | פרק מ"ג כבר בארנו בחיבורנו |
| פרק ל"ו דע כי אמתת הנבואה | פרק מ"ד הנבואה אמנם תהיה |
| פרק ל"ז צריך שתתעורר על | פרק מ"ה ואחר מה שקדם |
| פרק ל"ח דע כי בכל בני אדם | פרק מ"ו מן האיש האחד |
| פרק ל"ט אחר שדברנו במהות | פרק מ"ז אין ספק שכבר |
| פרק מ' כבר התבאר תכלית | פרק מ"ח מבואר הוא מאד |
נשלמו מ"ח פרקים של החלק השני של המורה